这一年来得运行认为强力机构不宜统一指挥，以免出现希姆莱或者贝利亚式的人物。所以它的属下部门全部被肢解掉。警察总部归属中央政务院管辖，以显示其主要是“民政”的特点。海关总署由财政总监分管；政治保卫总署改称总局，归仲裁庭管辖。
撤销工业及能源委员会，将其属下的机械工业部、能源部、冶金部、轻工业部划归制造总监管辖，新成立专门的科技部负责研发设计。科研部除了复活科技，还有寻找代用品和简化生产工艺的任务。
撤销外交与商业委员会，其属下外事部、外贸公司、驻外站改由殖民及贸易长官分管，另新设殖民事务部，负责对殖民地进行管理。
撤销财政金融委员会，改设财政部，由财政总监分管。德隆粮行正式改称为德隆银行，在正式的中央银行没有成立之前代行央行职责；新成立专卖局，穿越集团已经决定对食盐和烟草实行专卖制度。
“我决定辞去总参谋长一职。”在讨论到新的军事机构设置的时候，马千瞩提出了辞呈，“我现在是国务卿，没有理由继续担任军职。恳请执委会批准我的辞呈。”
辞呈随后被批准。穿越集团现在的总参谋长的职位相当于陆海军总司令，职权和影响力都过大，元老们普遍认为这个职务不能由执委会中的强力人物担任。马千瞩过去是计划人民委员，现在是国务卿，再担任总参谋长已经极不合适。
新体制下，总参归属在军务总管管辖下。总参谋部下设置联席会议，各军兵种参谋长、兵种总监参加，主要职能是兵种的协调和进行合作参谋。另将原先的陆军部政治处划归总参谋部，改称总参政治处，负责全军的思想政治和宣传工作
陆军和海军执行军政军令分开体制，陆、海军均不设司令官职务。陆军人民委员和海军人民委员不再是原先的司令官的角色，而是军队的行政首脑。负责管理陆海军的军政；训练作战由陆军参谋长和海军军令部长负责。这个体制可以有效的加强对军队的管理和约束。
由于穿越集团建立起来的军队对物资的消耗极大，对后勤的需求达到了本时空前所未有的新高度，根据军方的建议成立了后勤司令部，执行陆海军联勤管理。同时，为了满足军队规模膨胀的需求，新设训练总监部，负责陆海军新兵训练和劳工军事训练。
原来归属在陆军建制下的特侦队现在被提升为独立机构，直辖于军务总管。实际上是受执委会的直接调遣。执委会指望特侦队除了完成它的本职工作，还要担任执委会的近卫军和军队
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