断绝，兵疲粮竭，司马睿又始终拒绝派兵赴援，山穷水尽的愍帝被迫出降。
当这一消息被传到江南时，司马睿整军宿营，作出一副发动北伐以解救愍帝的模样。数天之后，这场政治表演便不了了之。
年底，晋愍帝被汉赵君主刘聪杀死。自此，司马睿称帝的阻碍消失，开始筹划即位前的事宜。
司马睿终于登上了皇帝宝座，东晋正式建立，称帝之后，司马睿虽然继续对王导、王敦加封官职，但是对王氏的厌恶情绪却愈发加重，态度上十分冷淡。
此外，司马睿还下诏命梁州刺史甘卓、广州刺史陶侃分领荆、江二州，从后方攻打王敦。
然而当王敦进抵建邺时，周札却献上石头城投降。刁协、刘隗、戴渊等人接连发起反攻，最终以失败告终。
王敦控制朝政后，先后杀害戴渊、周顗等人，并随意进退内外群臣。他还把司马睿软禁在宫中，取消了人身自由。
面对王敦的控制与羞辱，司马睿感到极度痛苦，心力交瘁，最终在永昌元年忧愤而死遗诏由太子司马绍继位，是为晋明帝。
司马绍即位两年后，依靠其他大族的支持，将第二次起兵企图篡夺帝位的王敦击败，终于平息了王敦之乱。
司马绍为人孝悌，文韬武略，聪明果断在位期间，凭借弱势之中央，成功制衡权臣世家，推动南方社会安定发展，停止追究王敦党羽，全力重用丞相王导，保持与江东士族和谐关系，稳定东晋的局势，对安定国家大局和巩固皇室权威影响深远。
在位三年，司马绍突然病逝，年仅二十七岁，谥号明皇帝，庙号肃宗，葬于武平陵。
由长子司马衍字世根，即位东晋第三位皇帝。
司马衍即位，因年幼由其母皇太后庾文君临朝听政。庾太后死后由王导与庾亮辅政。
在位期间，由于苏峻与祖约的叛乱，宫城迁移至石头城；直到四年以后陶侃、温峤平定苏峻之乱后才迁回建康。
司马衍禁止豪族将领将山川大泽私有化；以土断方式将自江北迁来的世族编入户籍。
几年以后，司马衍身体不适，下诏让他的弟弟琅琊王司马岳继承帝位；在西堂驾崩，享年二十二岁，谥号成皇帝，庙号显宗。
司马岳字世同，司马岳即皇帝位，是为晋康帝，大赦天下。命在各地屯兵驻守的文武将领和地方郡守官长，不可擅离职守前来奔丧。
可惜在位只有短短两年，没有大的政绩。但是他的书法造诣很深，代表作
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