在大唐上下完成备战之后，李世民召集了大臣们在两仪殿议事。
所有人到齐之后，李世民站在两仪殿内的巨大沙盘前开始讲话：“诸位，目前侯君集跟张公谨已经率幽州、营州一众将士及契丹、奚人各部，共计六万余兵马，在辽东对高句丽展开攻击。
突厥，西域，青海各部累计共三万余兵马也已经朝着辽东集结，此战动员规模之大，参战部族之多乃我大唐建国以来的首次，所以朕希望此战能够一战平定！”
随后李世民便开始进行安排。
首先定京师与后方留守中枢，以保中原根本不动、社稷安稳，杜绝远征空国之危。
太子李承乾坐镇定州监国，总领后方一切事务，节制河北诸州，凡征兵、转运、刑狱、安抚诸事，皆由太子总决。
辅监国五臣，各司专职，高士廉摄太子太傅，总领东宫纲纪、表率百官，掌后方礼制、人事黜陟、重臣督导，稳压后方朝局根本。
刘洎专掌后方刑名、庶务决断、百官监察，临机处置后方急务，统筹定州行在日常政务。
中书侍郎马周掌后方文书诏令、章奏审核、民情安抚，统筹河北州县吏治，安抚远征将士家眷。
于志宁辅佐东宫机务，掌东宫僚属管理、军旅文书交割、前后方讯息传递。
高季辅掌谏诤纠察、风纪整肃，督察后方官吏懈怠、克扣、渎职诸事，稳固后方吏治。
房玄龄独守长安，总摄关中百司、镇守京师根本，节制关中府兵、宿卫禁军，全权处置关内突发变故，确保中原腹地无一丝动荡。
后方留守人员确定，接下来就是跟随李世民御驾亲征的中军核心班底。
长孙无忌摄中军总机务，随军参决最高战略、调度诸军、统筹进退攻守，凡大军重大调度、伏兵布置、阵型变更、军情决断。
岑文本随军总掌全军粮草簿籍、军资出纳、文书诏敕、军功记录，总督行在机要文案，昼夜综理军旅庶务，操劳最剧。
杨师道参议军机、辅佐诏命草拟、随军甄别将士功过、临时铨选随军武官。
褚遂良随军记史、监察军纪、随时谏言，记录亲征全程始末，纠察军中骄纵懈怠。
尉迟敬德统领御前精锐亲卫骑兵，护驾扈从，战时为机动突击猛将，负责危局驰援、阵前破突。
中军之外，大唐主力则是分为辽东道陆路主力军、平壤道水路主力军，水陆两道分进合击，互不统属、各有主将，皆受天子节制。
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